據阿克蘇、巴楚等地一些棉企反映，10月下旬以來交儲競拍異常困難，柯坪某廠自10月中旬拍上一個280噸合同后，至11月11日已近1個月沒有再拍上；而“入庫”難的問題再次顯現，特別是巴楚兵團、阿克蘇兵團等庫因入儲量大，裝卸能力受限及初檢、復驗時間長等原因，不少棉企的合同被推遲到1周以后。
　　業內分析，一方面是南疆入儲庫容同棉花產量、交儲量不配套（除庫爾勒地區因直屬、代儲庫多，庫容達到100多萬噸外），特別是阿克蘇、喀什地區不僅倉庫少、產量大，而且2011、2012年度倉庫陳棉運出疆量較低，造成可入庫量有限；另一方面大量內地、新疆骨干企業或代拍企業存在，幾十個卡逐一拍阿克蘇或巴楚等地倉庫。
　　一些軋花表示，廠內已存有500-800噸皮棉，如果11月下旬前仍無法拍上合同，只能通達大單交儲企業交儲或想辦法請人代拍，否則占壓資金、銀行利息等都較高。
　　11月上旬以來，阿克蘇西大橋、柯坪和巴楚等地已有少數軋花廠提前停止籽棉收購，至11月15日前預計加工結束。主要原因是由于9月上旬至10月下旬籽棉收購價偏高，皮棉綜合生產成本已貼近國家收儲價格，而11月上旬雖籽棉品級下滑、衣分下降但收購價下跌不明顯；再加上部分棉企擔心交儲回款期過長，資金壓力大，而軋花廠為自已經營，不存在“保底”量的說法，因此在“收購無法放量，交儲又有一定虧損”的情況下提前結束收購和加工。
　　巴楚某廠表示，截止11月10日共收購12000噸籽棉（2條生產線），籽棉平均收購價9.58元/公斤（約41.6%的衣分），籽棉收購價高于去年0.53元/公斤，而目前棉籽銷售價僅在2.12-2.15元/公斤（廠內提貨），一旦后市棉籽價格補跌或公檢二級白棉的比例下滑，即使交儲成功虧損也再所難免。